Andere Allergien entwickeln sich unter verschiedenen immunologischen Mechanismen, ohne dass IgE beteiligt ist. Die häufigste ist das Kontaktekzem aufgrund von sehr kleinen Allergenen, die die Haut passieren und innerhalb von 24-48 Stunden an der Kontaktstelle eine Reaktion hervorrufen. Die Zöliakie ist eine weitere allergische Erkrankung, an der kein IgE beteiligt ist und die auf eine Empfindlichkeit gegenüber Gluten (ein Protein in Weizen und Roggen) zurückzuführen ist.

Sogenannte Unverträglichkeiten (z. B. gegen Aspirin oder Laktose) sind jedoch keine echten Allergien, da sie nicht als Allergene wirken oder von einer immunologischen Reaktion auf sie abhängen.