Devido à ação dos cílios nasais, o muco, que cobre as células epiteliais, move-se de forma contínua desde o vestíbulo nasal até à faringe, onde é engolido de forma inconsciente. Mais de 90% das partículas contidas no ar respirado ficam retidas no muco que, graças à função ciliar, é renovado constantemente.

A maior parte das doenças das vias respiratórias superiores, incluindo a infeção dos seios nasais, as alergias e a contaminação ambiental, alteram a função muco ciliar, quer seja por alterarem a atividade dos cílios nasais ou devido a alterações nas propriedades do muco. Se esta função for afetada, o movimento do muco abranda e as secreções são retidas, resultando na acumulação de contaminantes, alergenos e bactérias. Isso origina obstrução nasal, inflamação e infeção.

A irrigação nasal limpa a superfície mucosa do nariz e dos seios paranasais, o que ajuda a recuperar a limpeza muco ciliar ao eliminar tanto as substâncias que provocam a disfunção como as secreções que afetam negativamente o movimento ciliar.